Фамилия Комарков — один из тех случаев, когда прозвище, данное человеку, со временем стало родовым именем. В основе лежит слово «комар». Казалось бы, всё очевидно: предка могли дразнить за назойливость, худобу, писклявый голос или маленький рост. Но есть и менее прямое объяснение: в русских говорах «комарами» иногда называли не только насекомых, но и особый вид мошкары, а также — в переносном смысле — бойких, неотвязных людей.

Модель образования проста и типична для центральной России. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Комарков буквально значит «сын Комарка». А вот уменьшительная форма «Комарок» (или «Комарек») — деталь, которую часто упускают. Если бы фамилия пошла прямо от «Комар», мы бы имели Комаров. Наличие же суффинкса -ок говорит о том, что прозвище было не грубым, а скорее бытовым, даже ласкательным: Комарок — маленький, юркий или младший в семье. Такие формы давали детям или невысоким взрослым.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к северо-восточным и центральным областям: Вологодчина, Костромская, Нижегородская, отчасти Рязанская земля. В этих краях слово «комар» в местных говорах имело и дополнительные значения. Например, в вологодских диалектах «комарить» означало «бездельничать, шататься без дела», так что прозвище могло получить и ленивый работник — хотя эта версия менее надёжна, чем прямая «комариная» аналогия.

Интересно, что фамилия Комарков встречается заметно реже, чем Комаров. Это объясняется именно формантом: -ов в паре с основой на твёрдый согласный — самая массовая модель, а -ков (при основе на -ок) — более редкий вариант, сохранившийся в локальных очагах. В документах XVI–XVII веков, например в переписных книгах, можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Комарок, которое потом закрепилось за их потомками.

Никакого дворянского или знатного происхождения у Комарковых, скорее всего, нет. Это фамилия крестьянская, мещанская или казачья — типичная для людей, чьё прозвище подмечало внешность или характер, но не социальный статус.