Фамилия Конаныхин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Конаныхин послужило церковное имя Конон. Конаныха — просторечная форма христианского имени Конон, которое в переводе с греческого означает «трудящийся, трудолюбивый». В истории православия известны четыре святых покровителя этого имени: преподобный Конон, игумен Пентукла (день его памяти приходится на 4 марта), мученик Конон Исаврийский (18 марта), преподобномученик Конон (19 марта) и мученик Конон Римлянин (18 июня). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Конаныха, со временем получил фамилию Конаныхин. О точном месте и времени возникновения фамилии Конаныхин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Конаныхин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.