Фамилия Кончалин на первый взгляд кажется простой, но её происхождение неоднозначно. Скорее всего, в её основе лежит нецерковное имя или прозвище Кончало. Такие имена были распространены в русской деревне: Кончал, Кончала, Кончалка. Что они означали? Самое прямое объяснение — от глагола «кончать». Прозвище могли дать человеку, который доводил дело до конца, был решительным и последовательным. Либо, наоборот, тому, кто «кончал» споры, улаживал ссоры. В этом случае фамилия несла положительный, уважительный оттенок.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Кончалин, то есть сын Кончалы. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. Если бы основой было имя Кончал (мужского рода, без окончания), фамилия звучала бы как Кончалов. Но форма Кончалин закрепилась, значит, исходное прозвище было именно Кончала.

Есть и менее очевидная версия. В некоторых говорах «кончал» могли называть островерхий стог сена или сноп. Такое прозвище мог получить крестьянин, который умел складывать высокие, ровные стога. В этом случае фамилия указывала бы на род занятий или хозяйственную сноровку предка.

Встречается вариант с ударением на второй слог — Конча́лин. Это может быть связано с местным произношением или с тем, что в основе лежало не имя, а топоним: название села Кончалово или Кончалино. Тогда фамилия означала бы «выходец из тех мест». Такие «географические» фамилии часто меняли ударение, подстраиваясь под исходное название.

Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий не фигурирует. Встречается в центральных областях России, особенно в Тверской и Московской губерниях, а также среди старообрядцев. Это может говорить о том, что фамилия не была «столичной», а бытовала в среде крестьян или ремесленников.