Фамилия Кондоатов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней сразу обращает на себя внимание необычное сочетание «-оа-» в корне, что нетипично для исконно русских слов. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или имени, которое пришло из языков народов Кавказа или тюркской группы.

Наиболее вероятная версия связывает основу «Кондоат» с тюркским словом «кондак» или «кондык», означающим «маленький колокольчик», «бубенчик», а иногда и «подвеска». В переносном смысле так могли прозвать человека звонкого, говорливого или же того, кто носил украшения с бубенцами. В русской среде это прозвище могло трансформироваться в фамилию через типичный суффикс принадлежности -ов, указывающий на родство: «сын Кондоата».

Менее вероятная, но тоже возможная версия — греческое происхождение. В греческом языке есть слово «κονδάτος» (kondatos), означающее «короткий», «куцый». Такое прозвище могло относиться к человеку невысокого роста или с какой-то особенностью одежды. Однако греческий корень обычно даёт фамилии с окончанием на -ос (Кондатос), а русская форма Кондоатов могла возникнуть при переселении греков в Россию и адаптации фамилии к местным нормам.

Что касается географии, фамилия Кондоатов встречается крайне редко. Основные следы ведут в южные регионы России, особенно в Ростовскую область, Краснодарский и Ставропольский края, а также в Закавказье. Там исторически смешивались русские, греческие, тюркские и кавказские народы, что и могло породить такую необычную форму.

Таким образом, предки Кондоатовых, скорее всего, были людьми из среды казачества или крестьян южных окраин Российской империи, получившими прозвище за характерную черту — звонкий голос или, возможно, за невысокий рост. Фамилия сохранила в себе отголосок тех языков и культур, которые когда-то соприкасались на этих землях.