Фамилия Кондоатова — редкая и нестандартная для русского уха. Её происхождение не лежит на поверхности, и привычный разбор по схеме «имя-прозвище-суффикс» здесь не срабатывает. В первую очередь стоит обратить внимание на необычное сочетание звуков: «Кондо-» и «-атова». Если бы это была типичная русская фамилия, она оканчивалась бы на -ов/-ев или -ин, а здесь мы видим суффикс -ат- и окончание -ова, что характерно для фамилий, образованных от прозвищ или слов с суффиксом -ат(ый), — например, «бородатый» → Бородатов, «горбатый» → Горбатов. В таком случае основа «Кондо-» могла быть прозвищем человека.

Наиболее вероятная версия: фамилия восходит к прозвищу Кондатый, которое могло означать либо «короткий, куцый» (от диалектного «конда» — коротышка, обрубок), либо «крепкий, сбитый» (от тюркского или финно-угорского корня со значением «прочный», «коренастый»). В северных и сибирских говорах слово «конда» также обозначало смолистую древесину, сухостойную сосну — прозвище могли дать плотнику, лесорубу или человеку с жёстким, «смолистым» характером. Вариант с тюркским влиянием (сравните с татарским «конды» — «сел», «осел») тоже возможен, но менее вероятен для фамилии с русским суффиксом.

Суффикс -ат- и окончание -ова указывают на то, что фамилия образована от притяжательной формы: «чей?» — Кондоатова, то есть «жена (или дочь) Кондатого». Изначально это было прозвище мужчины — Кондатый, а женская форма закрепилась, если родоначальницей была женщина (например, вдова или дочь, по которой пошла фамилия). В русской традиции такие случаи встречаются, но реже, чем мужские варианты.

Географически фамилия Кондоатова, скорее всего, связана с северными регионами России (Архангельская, Вологодская области) или с Уралом, где сохранились диалектные слова с корнем «конд-». В центральных и южных областях она практически не встречается. Известных носителей с этой фамилией в публичном поле нет, что подчёркивает её локальный и редкий характер.

Таким образом, предки человека с фамилией Кондоатова могли быть крестьянами или ремесленниками из северных губерний, а прозвище Кондатый, от которого она произошла, скорее всего, описывало внешность (коренастый, короткий) или род занятий (лесоруб, плотник). Спорных версий здесь немного, и самая прямая — от русского диалектного слова «конда» со значением «коротышка» или «смолистое дерево».