Фамилия Кондрачков — одна из тех, что образована по простой и распространённой модели, но с неочевидным на первый взгляд суффиксом. Основа здесь — имя Кондрат (разговорная форма канонического Кондратий, от латинского conditus — «пряный», в переносном смысле «устроенный, благоустроенный»). Однако фамилия звучит не как Кондратов, а как Кондрачков. Ключ — в суффиксе «-чк-».

В русском языке суффикс «-к-» прибавляли к основе имени, чтобы образовать уменьшительную или обиходную форму: Кондрат → Кондрачко. Форма на «-ко» была особенно типична для украинских и южнорусских говоров. Затем к этому прозвищу или патрониму (отчество от имени Кондрачко) добавили стандартный русский фамильный суффикс «-ов». Получилась цепочка: Кондрат → Кондрачко (сын или слуга Кондрата) → Кондрачков. Фактически, фамилия означает «потомок того, кого звали Кондрачко».

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях — там, где были сильны малороссийские диалекты и где отчества на «-ко» легко переходили в фамилии на «-ков». В писцовых книгах XVII века можно найти крестьян и казаков с именем Кондрачко, но сама фамилия в документах фиксируется позже, в XVIII–XIX веках, когда закрепилась у однодворцев и государственных крестьян.

Есть и другая, менее вероятная версия: от прозвища Кондрач — так могли назвать человека с резким, «кондратий хватил» характером (в народе «кондрашка» — удар, паралич). Но эта гипотеза слабая: прозвище Кондрач не зафиксировано в исторических источниках как самостоятельное, а форма Кондрачко встречается часто.

Таким образом, Кондрачковы — это потомки людей, которых в быту звали уменьшительно-ласкательно Кондрачко. Фамилия не редкая, но и не массовая: по данным переписей, её носит не более нескольких тысяч человек в России, преимущественно в Центральном Черноземье.