Фамилия Кондранин в своей основе имеет имя Кондраня — народную, бытовую форму крестильного имени Кондратий (в просторечии также Кондрат). Это имя пришло на Русь из греческого языка, где означало «широкоплечий». Церковь почитает нескольких святых с этим именем, в том числе мученика Кондрата Никодимийского, который, по преданию, утешал и поддерживал других христиан во время гонений.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кондранин, то есть сын, потомок Кондрани. Такая форма типична для фамилий, образованных от основ на -а или -я. Если бы в основе лежала полная форма Кондратий, мы бы скорее получили фамилию Кондратьев. А Кондранин идёт именно от уменьшительного или обиходного варианта имени — Кондраня, что было распространённой практикой в крестьянской и мещанской среде.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно: процесс закрепления фамилий в разных слоях населения шёл с XV по XIX век. Однако суффикс -ин и форма имени указывают на то, что фамилия могла сложиться в северных и центральных областях России, где такие модели особенно характерны. Среди известных носителей — Тимофей Владимирович Кондранин, доктор физико-математических наук, профессор. В отличие от распространённых версий, которые приписывают фамилии исключительно «дворянское» или «крестьянское» происхождение, Кондранины — пример того, как церковное имя, пройдя через народное произношение, дало начало фамилии, сохранившей живую связь с разговорной речью прошлого.