Фамилия Кондранин — типичный пример русской «патронимической» фамилии, то есть образованной от имени отца. В основе лежит имя Кондраня, которое является народной, обиходной формой крестильного имени Кондратий (или Кондрат). Само имя Кондратий пришло на Русь из греческого языка, где слово κοντράτος (kontratos) означало «широкоплечий». Таким образом, первый носитель фамилии был, скорее всего, сыном или потомком человека по прозвищу или имени Кондраня.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Кондранин», то есть «сын Кондрани». Эта модель образования фамилий (от основ на -а/-я) была широко распространена в северных и центральных областях России, а также в среде крестьянства и посадских людей. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имен и прозвищ на твердый согласный, суффикс -ин закрепился за основами, оканчивающимися на гласный или мягкий согласный.

С точки зрения церковной традиции, одним из небесных покровителей имени считается святой мученик Кондрат Никодимийский, который, по преданию, утешал и поддерживал гонимых христиан. В народном календаре это имя тоже было популярным, что и породило множество производных форм: Кондраша, Кондрюша, Кондраня. Последняя форма, хоть и менее распространенная, чем Кондрат, легла в основу фамилии Кондранин.

Среди известных носителей можно назвать Тимофея Владимировича Кондранина — доктора физико-математических наук, профессора, что говорит о том, что фамилия не была закреплена за каким-то одним узким сословием или регионом. В целом, фамилия не является редкой, но и не относится к числу массовых, как, например, Иванов или Петров. Её географическое бытование в основном связано с областями, где имя Кондратий было в ходу: центральные регионы России, Поволжье, а также частично Украина.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Кондратов, Кондратьев, Кондрашов, — то Кондранин стоит несколько особняком. Форма на -ин от имени Кондраня — это более архаичный и «домашний» вариант, тогда как фамилии на -ов/-ев чаще образовывались от полной или усеченной формы имени (Кондрат → Кондратов). Таким образом, предки человека с фамилией Кондранин, вероятно, в быту звали отца или основателя рода именно ласкательной формой Кондраня, что придаёт фамилии оттенок личной, семейной близости.