Фамилия Кондрашенкова — наглядный пример того, как отчество, образованное от обиходной формы имени, превратилось в наследственное родовое имя. В её основе лежит имя Кондраша, которое в русском быту веками служило сокращением от полного церковного имени Кондратий. Имя это греческого происхождения, от «ко́ндрос» — «зерно», но в народном сознании оно прочно ассоциировалось с простым, крепким человеком, «кондратом» в значении «коренастый, плотный».

Модель образования фамилии двойная. Сначала от имени Кондраша с помощью уменьшительного суффикса -енк- (как в украинских и южнорусских фамилиях) образовали прозвище или отчество Кондрашенко — «маленький Кондраша» или, чаще, «сын Кондраши». Затем, когда носитель такой фамилии оказался в среде великорусского населения, к основе добавили типичный русский суффикс -ов, а для женского рода — -а. Так из украинского или южнорусского Кондрашенко родилась русская фамилия Кондрашенкова. Смена суффикса — не ошибка, а естественная русификация, адаптация фамилии к новой языковой среде.

Встречается и мужской вариант — Кондрашенков. Оба варианта распространены в областях, где исторически смешивались русское и украинское население: в Курской, Белгородской, Воронежской, Ростовской областях. География фамилии подсказывает, что предки носителей были, скорее всего, крестьянами или мещанами, переезжавшими в центральные регионы России из Малороссии или южных губерний.

Стоит отметить, что фамилия не связана с кондитерским изделием «кондрашка» — это народное название удара или апоплексического удара, но в данном случае корень чисто антропонимический. Также не стоит путать её с фамилией Кондратьев: там основа — полное имя, а здесь — его разговорная форма с добавочным суффиксом, что делает фамилию более редкой и локально окрашенной.