Фамилия Кондратишин образована от мужского крестильного имени Кондратий. В переводе с латинского оно означает «четырехугольный» или «широкоплечий». Но в основу фамилии легла не полная форма имени, а уменьшительно-ласкательная — Кондратиша. Именно так в быту могли называть человека по имени Кондратий. Потомок этого человека со временем и получил фамилию Кондратишин.

Интересно, что на славянской почве церковное имя Кодрат (от лат. quadratus) трансформировалось в более привычное Кондрат, а затем и в Кондратий. Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного с суффиксом -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность к роду: «чей?» — Кондратишин, то есть сын или потомок Кондратиши.

Такая модель типична для фамилий, образованных от народных, обиходных форм крестильных имён. Если бы в основу легло полное имя, мы бы получили фамилию Кондратьев или Кондратов. Выбор именно уменьшительной формы Кондратиша говорит о том, что в семье или в окружении предка эту форму использовали постоянно — возможно, человек был младшим в роду или его так ласково называли в детстве, и прозвище закрепилось.

Фамилия редкая, географически тяготеет к западным и юго-западным регионам России, а также к украинским и белорусским землям, где суффикс -ин в фамилиях такого типа встречается чаще, чем в центральной России. Встречаются варианты написания с одной «с» — Кондратишин, что соответствует правилам русской орфографии, и с двумя — Кондратиссин, но последний считается ошибочным.