Фамилия Кондратцева образована от имени Кондратец — народной, разговорной формы крестильного имени Кондратий. Само имя Кондратий (латинское Contradus или греческое Kodratos, что значит «квадратный», «широкоплечий») пришло на Русь вместе с христианством и было популярно в среде духовенства и простых людей. Однако в фамилии Кондратцева мы видим не полное имя, а его уменьшительно-ласкательный вариант — Кондратец. Такая форма часто указывала на то, что основатель рода был человеком из простонародья: в крестьянской и посадской среде имена часто сокращали, добавляя суффикс -ец, чтобы подчеркнуть принадлежность к своему кругу.

Суффикс -ев в фамилии Кондратцева (а не -ов) говорит о том, что основа имени заканчивалась на мягкий согласный или -ц. По правилам русской ономастики, от имён на -ец образовывались фамилии с суффиксом -ев: Кондратец → Кондратцев. Это типичная модель для северных и центральных губерний России, где фамилии на -ев встречаются чаще, чем на юге. Интересно, что фамилия Кондратцева — женская форма, а мужской вариант — Кондратцев — встречается реже, но оба они восходят к одному корню.

В отличие от более распространённой фамилии Кондратьев (от полного имени Кондратий), форма Кондратцев — более редкая и локальная. Она могла закрепиться в какой-то конкретной местности, например, в Вологодской или Архангельской губерниях, где любили уменьшительные имена с суффиксом -ец. Скорее всего, предок носителей фамилии Кондратцева был не просто Кондратием, а именно Кондратцем — так в быту называли младшего члена семьи или человека невысокого роста, что добавляет фамилии оттенок теплоты и повседневности.