Фамилия Кондык — это переосмысленное прозвище, и у него как минимум три возможных корня. Самый прямой и бытовой — от слова «кондык», которое в пермских говорах означало «кадык», «гортань». Прозвище могли дать человеку с заметно выступающим кадыком: такая примета бросалась в глаза и легко закреплялась за носителем.

Другая версия ведёт к церковному термину «кондак» — краткая хвалебная песнь. В духовных семинариях прозвища часто давали по роду занятий: дети дьячков и пономарей, певшие в церкви кондаки, сами становились Кондаками или Кондыками. Если предок был низшим церковным служителем, прозвище могло закрепиться за ним по этой причине.

Третий вариант — тюркское слово «qondaq». У тюркских народов так называли овечью шерсть, в которую заворачивали новорождённого на несколько дней, прежде чем переложить в колыбель. Маловероятно, что прозвище возникло из этого бытового обряда напрямую, но полностью исключать тюркское влияние не стоит — фамилия могла появиться на южных или восточных окраинах России, где русские и тюркские говоры пересекались.

В некоторых говорах «кондак» означал ещё и «хитрый». Если прозвище давали по характеру, то предок мог быть человеком себе на уме. Однако эта версия менее убедительна: обычно прозвища по чертам характера строятся на более употребительных словах, а «кондык» — слово редкое, локальное.

Что объединяет все эти версии? Фамилия образована напрямую от прозвища, без суффикса — это так называемая «нулевая» модель, когда фамилия совпадает с исходным словом. Такие фамилии встречаются реже, чем на -ов или -ин, и часто указывают на украинское, белорусское или южнорусское происхождение. В случае с Кондыком региональная привязка сложнее: пермские говоры и тюркские заимствования указывают на разные ареалы.

Сословная принадлежность носителей фамилии не установлена: прозвище могли получить и крестьяне, и церковнослужители, и люди из смешанной этнической среды. Без дополнительных архивных данных определить точное происхождение для конкретной ветви невозможно.