Фамилия Кондюрина хранит память о прозвище дальнего предка — Кондюра. В основе этого прозвища, скорее всего, лежит тюркское слово «кондур», что значит «бобр» или «бобровый». Такое прозвище могли дать трудолюбивому человеку — бобр в народном сознании был символом упорства и хозяйственности. Но есть и более приземлённая версия: так могли прозвать человека с крупными передними зубами, по сходству с тем же бобром.

Вторая гипотеза связывает прозвище Кондюра с русскими диалектными словами «кандюк» (живот) и «кандючить» (копить гамзу или корпеть над деньгами). Если это так, то прозвище отражало характер: запасливый, прижимистый или даже скуповатый человек. Обе версии не противоречат друг другу — и трудолюбие, и бережливость могли быть заметными чертами, за которые цеплялось прозвище.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Кондюр- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Кондюры). Такой способ типичен для фамилий, возникших в северных и центральных губерниях России. География фамилии Кондюриных сегодня размыта, но корни стоит искать в регионах, где русские диалекты соседствовали с тюркскими языками — например, в Поволжье или на Южном Урале.