Фамилия Конинин образована от прозвища Конина, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «конское или лошадиное мясо». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Конининых продавал конское мясо. То есть прозвище указывало на род занятий предка. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе фамилии Конинин лежит не прозвище, а имя Конина, которое является производной формой от имени Конон, очень распространенного в старину. Это имя в переводе с греческого означает «трудящийся, трудолюбивый». Так и прозвище Конина закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Конинин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Конина, со временем получил фамилию Конинин.