Фамилия Кононников образована от крестильного имени Конон. В святцах это имя греческого происхождения, означающее «трудящийся» или «работающий», и связано с несколькими раннехристианскими святыми. В русской традиции имя Конон не было таким распространённым, как, скажем, Иван или Пётр, но встречалось, особенно в среде духовенства и крестьянства. От него произошли фамилии Кононов, Кононенко, Конончук и, конечно, Кононников.

Ключевая особенность этой фамилии — суффикс «-ник-». В русских фамилиях он обычно указывает на принадлежность или профессию: мельник — Мельников, плотник — Плотников. В случае с Кононниковым модель чуть сложнее. Сначала от имени Конон образовалась форма Кононник — так могли называть сына или человека, находящегося при Кононе (например, работника или слугу). Затем уже от прозвища Кононник возникла стандартная «овская» фамилия — Кононников, то есть «сын Кононника». Такая двойная суффиксация — признак того, что фамилия формировалась не в центре, а скорее в северных или поволжских говорах, где -ник- было продуктивным суффиксом для обозначения людей по отцу или занятию.

Встречается и другая, менее вероятная версия: основа могла быть связана не с именем, а с прозвищем Кононник от диалектного слова «конон» — так в некоторых областях называли скупого или упрямого человека. Но церковное имя Конон было достаточно популярно, чтобы считать фамилию патронимической — по имени предка.

По географии фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России. Встречается в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях, а также на Урале, куда переселенцы принесли её в XVII–XVIII веках. Если ваши предки Кононниковы, скорее всего, они были крестьянами или посадскими людьми — дворянских родов с такой фамилией почти не известно, а значит, её носители не принадлежали к высшему сословию.

С точки зрения словообразования, фамилия Кононников стоит в одном ряду с такими редкими формами, как Миронников, Сидорников или Фоминников, где к имени добавляется «ник» и затем «ов». Это отличает её от более массовых Кононовых и подчёркивает, что предок носителя был не просто Конон, а именно «Кононников человек» — возможно, младший в семье или пришлый, получивший прозвище по хозяину.