Фамилия Конопацький звучит как типичная польская или украинская фамилия, и это не случайно. Она образована по модели с суффиксом -цк-/-цьк- (в русской передаче — -цкий), который в восточнославянских землях чаще всего указывал на шляхетское или казацкое происхождение. В основе лежит прозвище или имя Конопат(а), которое, скорее всего, связано с коноплей — растением, из которого делали масло, верёвки и грубую ткань. Прямое значение: «тот, кто имеет отношение к конопле» — либо сеял её, либо обрабатывал, либо торговал. В польском языке слово konopaty означает «конопатый», то есть рябой (от конопли как эталона крапинок), но для фамилии более вероятна первая, «растительная» версия.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто давали крестьянам, форма на -ский (Конопацкий, Конопацький) была престижной. На Украине и в Польше её носили мелкие шляхтичи, которые владели хутором или селом с названием вроде Конопатки или Конопати. Встречается и другая версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Конопатый (рябой человек), но тогда ожидалась бы форма Конопатенко или Конопатов. Суффикс -цький указывает на географическую привязку: предок был «из Конопатого» — то есть из местности, где много конопли, или из села с похожим названием.

В исторических документах фамилия фиксируется в Подолье и на Волыни, а также среди украинской шляхты Речи Посполитой. Написание с мягким знаком (Конопацький) — украинская или полонизированная норма; в русском языке она обычно превращается в Конопацкий. Носители фамилии могли быть как землевладельцами, так и казаками, поскольку в Запорожской Сечи прозвища по ремёслам давали часто, и «конопляное» занятие было обычным. Сегодня фамилия редкая, но встречается в западной Украине и среди потомков эмигрантов.