Фамилия Конопухин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Конопухин образована от прозвища Конопуха. Скорее всего, так называли человека, лицо которого было покрыто веснушками или оспинами. Однако нельзя также исключить связь прозвища с глаголом «конопатить» - «пробивать щели, пазы конопатью, т.е. пенькой, паклей, хлопком, мохом и пр.». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Конопуха, со временем получил фамилию Конопухин. О точном месте и времени возникновения фамилии Конопухин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Конопухин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.