Фамилия Коплунов образована от прозвища или мирского имени Коплун. В её основе лежит слово «коплун» — так в южных и центральных говорах России называли индюка. В словаре Владимира Даля это слово зафиксировано именно в значении «индейский петух». Прозвища по названиям домашних птиц были в ходу у крестьян: за характер, походку, голос или внешность человека могли прозвать Гусаком, Петухом, Индюком. Коплун — тот же индюк, но с диалектным оттенком.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Коплуна» или «из семьи Коплуновых». Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Коплуно́в, хотя в некоторых регионах могли произносить и Ко́плунов. Вариант написания с одним «н» (Коплунов) — единственно верный, так как суффикс -ов присоединяется к основе Коплун.

Исторически фамилия Коплунов могла возникнуть в среде однодворцев или крестьян южных губерний России — Курской, Воронежской, Тамбовской, где диалектное слово «коплун» было распространено. Носители фамилии, вероятно, не были напрямую связаны с разведением индеек: прозвище могло закрепиться за человеком с пышным, важным видом или за тем, кто любил «надуваться» от гордости. Встречается и менее очевидная версия: в некоторых говорах «коплун» — это вариант слова «копыл» (короткая деталь в санях или ткацком станке), но она менее убедительна, так как форма «коплун» для «копыла» редка и не подкреплена словарями.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Копылов, Копытин — показывает, что Коплунов стоит особняком: у него иная основа и другое ассоциативное поле. Если Копыловы почти всегда «происходят» от детали саней или обуви, то Коплуновы — от птицы. Эта фамилия не относится к числу частых, но встречается в документах XIX века по Тамбовской и Саратовской губерниям. Среди известных носителей нет общезначимых фигур, что типично для фамилии, закрепившейся в крестьянской среде без выхода в дворянство или купечество.