Фамилия Копыленков — один из тех случаев, когда модель образования подсказывает ответ быстрее, чем разбор корня. Двойной суффикс «-енк-ов» — верный признак украинского или белорусского происхождения фамилии, которая позже обрусела. В России фамилии на «-енков» (вроде Коваленков, Бондаренков) обычно появлялись, когда носителя украинской фамилии на «-енко» записывали по русской патронимической схеме: «чей?» — Копыленков. То есть исходная форма — Копыленко, а «-ов» добавили, чтобы вписать в местную традицию.

Теперь о корне. Основа «копыл» многозначна, и это даёт сразу две правдоподобные версии. Первая — ремесленная: копылом на Руси называли деталь саней или ткацкого станка, а также колодку для сапожников. Прозвище Копыл могли дать сапожнику, плотнику или мастеру по дереву. Вторая версия — антропонимическая: в старых псковских и новгородских говорах «копыл» означало коротышку или человека низкого роста (от «копылять» — укорачивать). Обе гипотезы рабочие, но первая встречается в ономастике чаще, так как прозвища по профессии давали устойчивее, чем по внешности.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) модель на «-енков» последовательно выводится из украинского «-енко» с последующей русификацией. Фамилия Копыленков — не исключение. При этом сама фамилия Копыленко (без «-ов») довольно распространена на востоке Украины и в южных областях России, что подтверждает географию: предки носителя Копыленкова, скорее всего, переселились из черниговских или полтавских земель в великорусские губернии в XVII–XVIII веках.

С точки зрения сословной принадлежности, фамилия не элитарная. Крестьяне и мещане, реже — однодворцы. Фамилии на «-енков» редко встречались у дворянства, поскольку те предпочитали модели на «-ский» или «-ов» без промежуточного суффикса. Так что с высокой вероятностью предки Копыленковых — ремесленники или вольные хлебопашцы, чья фамилия закрепилась в документах при переписях после вхождения украинских земель в состав Российской империи.