Фамилия Корень — одна из тех, где значение лежит на поверхности, но за ним скрывается не одна, а как минимум две равноправные версии происхождения. И обе ведут к одному и тому же слову — «корень», то есть подземная часть растения.

Первая и самая прямая версия — профессиональная. Прозвище Корень могли дать человеку, который занимался сбором дикорастущих трав и кореньев. В традиционном хозяйстве это было не просто подспорье, а отдельное ремесло: коренья шли в пищу, на корм скоту, а лекарственные растения — в домашнюю аптеку. Так что предок носителя фамилии вполне мог быть травником или знахарем, хорошо знавшим, где и что искать в лесу.

Вторая версия отталкивается от переносного смысла слова. В народной речи «корень» нередко становился характеристикой человека — упрямого, основательного, «глубокого» в своих убеждениях. Такое прозвище могли дать человеку с твёрдым, несгибаемым характером, который, как корень, держался своего и не поддавался на уговоры.

С точки зрения словообразования фамилия Корень — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию без изменений, без суффикса. Это так называемая «чистая» форма, которая характерна для украинской и белорусской традиции, но встречается и в русской среде, особенно на юге. В северных и центральных областях России от того же корня чаще образовывали фамилии с суффиксами — Коренев, Кореньков, Коренякин.

Однозначно определить, какая из версий верна для конкретной семьи, невозможно без изучения истории рода. Но обе они — и ремесленная, и характерологическая — вполне реальны и не противоречат друг другу.