Фамилия Корнукий — редкая и нестандартная. Её звучание сразу цепляет внимание, а происхождение не лежит на поверхности. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, она не заканчивается на -ов, -ев, -ин или -ский. Суффикс -ий указывает на прилагательное, но такие окончания чаще встречаются у фамилий польского, украинского или белорусского происхождения (Высоцкий, Яворский, Борткевич). Здесь же основа — «корнук-», что заставляет искать корни в диалектах или прозвищах.

Наиболее вероятная версия — прозвищное происхождение от слова «корнук». В русских говорах, особенно южных и западных, «корнуком» могли называть человека с кривым, искривлённым носом или ртом (от диалектного «корный» — кривой, короткий). В украинском языке «корнути» означает «согнуть, скривить». Таким образом, Корнукий — это тот, кто получил уличное прозвище по характерной черте внешности, а затем фамилия закрепилась в форме прилагательного: «чей?» — Корнукий.

Менее убедительна, но возможна связь с тюркскими корнями, где «кор» может означать «слепой» или «глухой», а «нук» — суффикс. Однако для фамилии, бытующей в славянской среде, диалектная версия выглядит естественнее. Географически фамилия Корнукий встречается крайне редко, в основном на западе России и в Беларуси — как раз в зоне смешения говоров, где сохранились такие диалектизмы.

Фамилия не принадлежала дворянству или духовенству — её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, получившими прозвище в быту. В метрических книгах XIX века такую фамилию могли записать не сразу: сначала человека звали «Корнук», а уже его детей — «Корнукие». Это типичная модель для западнорусских земель, где фамилии на -ий образовывались от прозвищ без дополнительных суффиксов.