Фамилия Коробенин — один из тех редких случаев, когда за основу взято не ремесло, не профессия и не имя, а, скорее всего, прозвище, связанное с предметом быта. Слово «короб» на Руси означало лубяную или берестяную ёмкость, кузов, сундук для хранения вещей. От него образовалось множество прозвищ: Короб, Коробей, Коробка, Коробок. И если фамилия Коробейников прямо указывает на торговца-коробейника, то Коробенин — это «сын Коробени» или «из рода Коробени».

Суффикс -ин здесь стандартен для русского языка: он присоединяется к основам на -а, -я. «Коробеня» — это и есть та самая основа, прозвище человека. В говорах слово «коробеня» могло означать не просто короб, а нечто громоздкое, пузатое, неуклюжее — так могли прозвать медлительного, полного или неповоротливого человека. Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: прозвище дали тому, кто делал короба, то есть коробейнику, но в местном диалекте слово звучало именно как «коробеня».

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчине, Костромской, Ярославской губерниям. Именно там была сильна традиция плетения из бересты и луба, и прозвища от «короба» встречались чаще. Встречается вариант написания через «а» — Коробенин, хотя словари фиксируют и форму Коробенин как более старую. Написание с буквой «ё» (Коробёнин) — результат поздней орфографической путаницы, когда в документах ставили «е» вместо «ё».

С точки зрения социальной истории, предки Коробениных вряд ли принадлежали к высшей знати. Фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени, что характерно для крестьянской и посадской среды. В писцовых книгах XVI–XVII веков, где фиксировали крестьян, встречаются упоминания людей с прозвищем Коробеня, но массово фамилия закрепилась уже после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово давали фамилии по прозвищам предков. Таким образом, Коробенин — это фамилия-характеристика, которая за столетия потеряла связь с исходным значением и стала просто родовым именем.