Фамилия Коротоножкин образована от прозвища Коротоножка, и её основа прозрачна: сложение слов «короткий» и «нога». Прозвище, скорее всего, описывало внешность — человека с короткими ногами. Такие прозвища по физической особенности были в ходу в славянской среде: они давались наглядно и без обидного оттенка, скорее как меткая бытовая примета. Суффикс -кин указывает на принадлежность: Коротоножкин — это «сын Коротоножки», то есть потомок того, кого прозвали за коротконогость.

Модель образования фамилии по типу «отчество + -ин» (здесь -кин после шипящего «ж») характерна для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей. В дворянской среде такие «говорящие» прозвища встречались реже — там предпочитали формы на -ов/-ев от географических названий или церковных имён. Так что Коротоножкины, скорее всего, происходят из простонародья.

Интересная деталь: фамилия редкая. Встречается в основном в центральных и южных областях России, но не массово. Это говорит о том, что прозвище не стало общим для целого села, а закрепилось за одной ветвью. По сравнению с однокоренными фамилиями вроде Коротаевых (от «короткий») или Ножкиных (от «нога»), Коротоножкины сохранили составную основу, что делает их фамилию более живой и прямой по смыслу.

Окончательно определить точное место и время возникновения фамилии можно только по архивным записям: переписям, ревизским сказкам, метрическим книгам. Но уже сейчас ясно, что Коротоножкин — это памятник народной наблюдательности и языковой игры, где внешность человека превратилась в родовое имя.