Фамилия Коротуненко — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель «нанизывает» суффиксы, создавая фамилию, которая издалека выдаёт регион происхождения. В основе лежит прозвище Коротун, а финальный суффикс -енко однозначно указывает на территорию современной Украины, где такие фамилии были особенно массовыми в XVII–XVIII веках.

Само прозвище Коротун образовано от прилагательного «короткий». В славянской антропонимии это могло относиться к невысокому росту человека. Однако есть и более конкретная версия: в украинских говорах «коротун» иногда называли человека с короткой шеей или того, кто носил короткую одежду (например, короткую свитку). Прозвище было не обидным, а описательным — так в быту могли закрепить за человеком яркую внешнюю черту.

Суффикс -енко в украинской традиции — это патронимический показатель, означающий «сын» или «потомок». Коротуненко буквально читается как «сын Коротуна» или «маленький Коротун». Такая модель была особенно популярна среди казачества и крестьянства Левобережной Украины (Черниговщина, Полтавщина, Слобожанщина), где фамилии на -енко со временем стали наследственными и перестали зависеть от возраста носителя.

Интересно, что в русском языке есть однокоренная фамилия Коротков, но она образована по другой модели (суффикс -ов). Коротуненко же сохранила украинскую огласовку и структуру. Встречается также вариант Коротун, без патронимического суффикса — он мог остаться у того, кто сам носил прозвище, а его дети уже стали Коротуненками.

Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане. В метрических книгах XIX века Коротуненко чаще всего фиксировали в Полтавской и Харьковской губерниях. Сегодня фамилия остаётся характерной для Украины, но встречается и в России, куда её принесли переселенцы во время столыпинской аграрной реформы и в советские годы.