Фамилия Кошубаро — редкий случай в русском ономастиконе, и её разговор стоит начать не с корня, а с окончания. Конечное «-о» в фамилиях — явление нетипичное для великорусской модели, где преобладают суффиксы -ов/-ев, -ин. Такое окончание — верный признак украинского или белорусского влияния: в украинской ономастике добавление конечного гласного «о» к прозвищу при образовании фамилии — обычное дело. Именно так из прозвища Кошубар и получилась фамилия Кошубаро.

Само прозвище Кошубар, скорее всего, восходит к этнониму «кашубы» (самоназвание — кашеби). Кашубы — западнославянский народ, исторически живший в Поморье (север современной Польши). Основатель рода Кошубаро либо долгое время жил на территории, заселенной кашубами, либо имел кашубское происхождение. В славянской традиции прозвища по этническому признаку давали пришлым людям: если человек переселялся в другую местность, его могли прозвать «Лях», «Немец» или, в данном случае, «Кошубар».

Позже прозвище Кошубар, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его — и в повседневной жизни, и в официальных документах. Фамилия осталась в форме Кошубаро, закрепив за потомками память о западнославянских корнях предка.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что вариант с «-о» встречается реже, чем более привычные Кошубар или Кошубаров. Последние — результат обрусе́ния исходного прозвища с помощью русского патронимического суффикса. А Кошубаро — та самая форма, которая сохранила южнорусский или украинский след.