Фамилия Кошубина хранит память о происхождении своего первого носителя, но не через имя или ремесло, а через этническую принадлежность. В основе фамилии лежит прозвище Кошуба, которое восходит к самоназванию западнославянского народа — кашубы (кашеби). Это указывает на то, что основатель рода либо сам происходил из кашубов, либо долгое время жил на их исторической территории — в Поморье, на севере современной Польши. Не исключено и более простое объяснение: прозвище Кошуба могли дать человеку, который внешне или по привычкам напоминал кашубов — например, говорил с характерным акцентом или носил одежду, свойственную этой народности.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Кошубина — это «дочь или жена Кошубы», а в родовом значении — «потомок Кошубы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или личных имён, оканчивающихся на -а.

В ономастике фамилия Кошубина — редкий случай, когда в основе лежит не просто прозвище, а именно этноним, причём не самый распространённый. Кашубы — одна из самых малочисленных славянских народностей, их язык и культура долгое время находились под сильным немецким влиянием. Поэтому фамилия могла возникнуть в регионах, где были контакты с переселенцами из Поморья — например, на северо-западе России или среди старообрядцев, которые иногда уходили в те края.

Встречается фамилия и в форме Кошубин — без конечного -а, что характерно для мужского варианта. Обе формы фиксируются в документах, но женская (Кошубина) в русской традиции часто сохраняется как исходная, если речь идёт о родоначальнице. В любом случае, носитель фамилии может с полным правом считать её ценным источником семейной истории: передаваясь из поколения в поколение, она по сей день хранит память о происхождении индивида, пусть и через столетия после того, как прозвище превратилось в родовое имя.