Фамилия Кошубин — одна из тех, что указывает на этнические корни или долгие связи с определённым народом. В её основе лежит прозвище Кошуба, которое напрямую восходит к самоназванию западнославянской группы — кашубы (по-кашубски — «кашеби»). Кашубы исторически населяют север Польши, район Поморья, и до сих пор сохраняют свой язык и культуру.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии Кошубин либо жил среди кашубов, либо сам был выходцем из этой среды. В русской среде такое прозвище могли дать человеку, который переселился с кашубских земель, или тому, кто внешне или по манерам напоминал кашуба — например, говорил с характерным акцентом или носил необычную одежду. В XVI–XVII веках контакты между Русским государством и Речью Посполитой были интенсивными, так что появление в русских землях людей с кашубскими корнями — не редкость.

Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель образования фамилий от основ на -а: Кошуба → Кошубин. Это значит, что фамилия закрепилась в среде, где говорили по-русски, а сам носитель прозвища уже не был прямым кашубом, а воспринимался как «человек Кошубы».

Стоит заметить, что фамилия редкая. Она не встречается массово ни в одном регионе, что подтверждает её узкое, почти семейное происхождение. В отличие от распространённых «географических» фамилий вроде Поляков или Немцов, Кошубин отсылает к конкретной и малочисленной этнической группе, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска.