Фамилия Котуковы (в мужском варианте Котуков) чаще всего связывают с тюркскими корнями, уходящими в эпоху Золотой Орды. Основой послужило личное имя Котук (или Кутук), которое восходит к тюркскому слову «кут» — «счастье, душа, жизненная сила, дух». Таким образом, имя Котук означало «счастливый дух»: родители давали его сыну с пожеланием счастливой судьбы. Эта модель образования типична для фамилий, возникших в XV–XVII веках, когда выходцы из ордынской знати, печенегов или половцев оседали на русских землях и переходили на русскую службу.

Интересно, что фамилия Котуков не единственная в этом ряду. Близкий вариант — Кутуков — встречается и у русских, и у казахов, что подтверждает общность корня. В русской среде такие фамилии закрепились благодаря тому, что многие нерусские по происхождению дворяне и служилые люди входили в состав российского дворянства, принося с собой свои родовые имена. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель патронимического образования: «чей?» — Котуков, то есть сын или потомок человека по имени Котук.

Сведения о восточном происхождении фамилии Котуков считаются достаточно точными и подтверждаются данными ономастики: имя родоначальника явно тюркское, а не славянское. Поэтому версия о происхождении от прозвища, связанного с русским словом «кот», маловероятна — она не объясняет ни характерного окончания, ни семантики корня. Таким образом, фамилия Котуков — не просто бытовое прозвище, а памятник восточной письменности и культуры, сохранивший в себе отголосок древних тюркских верований, где «кут» считался особой благодатной силой.