Фамилия Койшибаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Койшибаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Койшибаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Койшибаев состоит из двух восточных основ: «койши», что в переводе с казахского означает «пастух» и «бай» в значении «господин, хозяин, состоятельный влиятельный человек». Так, в целом именование Койшибай можно перевести «состоятельный пастух», однако скорее всего оно имеет значение «хозяин пастухов, пастбища». А именование Койша упоминается в реестре 1756 г. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Койшибаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Койшибаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.