Фамилия Кожаканов — редкий пример, где тюркская основа и русский суффикс сплелись воедино, но не самым очевидным образом. Если сразу искать в ней слово «кожа», можно уйти не туда: скорее всего, в основе лежит тюркское личное имя или прозвище Кожак / Кожакай. «Кожа» (qoja, khoja) в тюркских языках — это не материал, а духовный титул: «ходжа», «господин», «наставник», часто потомок пророка или просто уважаемый человек. Уменьшительный аффикс -ка (-кей) придаёт имени оттенок «маленький ходжа» или «сын ходжи». Получается, Кожака — это уменьшительно-ласкательная форма от Кожа, а «Кожаканов» — буквально «сын (потомок) маленького ходжи».

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий, которая в XIX веке активно накладывалась на тюркские имена у народов Поволжья, Приуралья и Казахстана. Носители фамилии Кожаканов — почти наверняка потомки тех, кто попал в ревизские сказки или метрические книги уже с русифицированным окончанием. Интересно, что в самой фамилии сохранился двойной «а» в середине — это след от тюркского суффикса -ка, который в русском восприятии не отсекли, а присоединили к основе. Встречаются варианты написания Кожаканов и Кожоканов, но первый — основной.

В ономастических справочниках (например, у Баскакова в «Русских фамилиях тюркского происхождения») фамилия не упоминается, что говорит о её редкости. Географически она чаще всего фиксируется в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане — то есть в зоне давних контактов тюркского и русского населения. Социальный контекст: предки Кожакановых могли быть муллами, учителями или просто уважаемыми старейшинами в ауле, поскольку титул «кожа» передавался по наследству. Однако с течением времени фамилия стала рядовой, и её носители — люди самых разных профессий.

Есть и более прозаичная версия, которую стоит упомянуть для полноты: в некоторых диалектах тюркских языков «кожак» значит «баран» или «козёл» (ср. казахское «қошқар»). Но вряд ли прозвище «бараний» дали бы с уменьшительным суффиксом, да и титульная версия выглядит весомее. Так что Кожаканов — это фамилия, которая несёт в себе отпечаток духовного авторитета, пусть и сжатого до двух суффиксов.