Фамилия Кожакин образована от прозвища Кожака, в основе которого лежит нарицательное «кожа». Кожа — это наружный покров организма животного. Так и прозвище Кожака закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Кожакин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кожака, со временем получил фамилию Кожакин.