Фамилия Коженко — характерный пример украинской модели фамилии на -енко, самой массовой в этой ономастической традиции. Суффикс -енко в украинских фамилиях указывал на происхождение по отцу: буквально «сын такого-то» или «маленький, младший». В данном случае основа — Кожен, что является краткой формой от прозвища или имени Коженко (ср. Кожен, Кожан) или же напрямую от слова «кожа».

Разбирать фамилию стоит от корня «кож-». В восточнославянской среде это слово имело два основных значения. Первое — материал, шкура животного. Второе — кожа как часть тела, причем в переносном смысле «кожей» могли называть худого, изможденного человека («кожа да кости»). Однако наиболее вероятная версия связывает фамилию с ремеслом: кожевник, кожемяка. В украинских говорах слово «кожен» (или «кожан») могло обозначать мастера по обработке кожи — кожевника. Таким образом, прозвище Кожен давали человеку, занимавшемуся выделкой шкур, изготовлением кожаных изделий.

Встречается и менее распространенная версия, идущая от украинского прилагательного «кожен» (каждый). В этом случае прозвище могло получить человек, который был «каждым» в смысле всеобщего, доступного или родившегося в многодетной семье, где дети шли «один за одним». Но эта гипотеза слабее, так как в основе фамилий редко лежат местоимения, и она не подтверждается типовыми моделями прозвищ.

Географически фамилия Коженко сосредоточена в центральных и восточных областях Украины, особенно в Полтавской, Черкасской, Киевской и Сумской областях. Это типичная казацкая фамилия, распространенная среди потомков реестрового казачества и крестьянства. В России фамилия встречается реже, чаще всего у потомков переселенцев с Украины.

Интересная деталь: в отличие от более распространенной фамилии Кожевников (с суффиксом -ов), Коженко сохранила украинский уменьшительно-патронимический суффикс. Это сразу указывает на регион происхождения. В документах XVIII–XIX веков фамилия могла записываться как Коженко, Кожанко или даже Коженков (под влиянием русской канцелярской традиции), но современное написание закрепилось именно с окончанием -ко. Таким образом, предок носителя фамилии Коженко с высокой вероятностью был кожевником, мастером по выделке кож в одном из украинских местечек или хуторов.