Фамилия Кожухар — яркий пример «профессионального» прозвища, которое закрепилось за родом занятий предка. В основе лежит слово «кожух» — так на Руси называли тулуп из овчины, короткую шубу мехом внутрь. Соответственно, Кожухаром в народе прозвали портного или скорняка, который шил такие кожухи.

Словообразовательная модель здесь нестандартная для русских фамилий: суффикс -арь (в упрощённом произношении -ар) указывает на деятеля по аналогии с писарь, пекарь, знахарь. Однако в фамилии он редуцировался до -ар, что характерно скорее для южнорусских и украинских говоров. Этот суффикс придаёт прозвищу оттенок активного, умелого мастера, а не просто «того, кто имеет отношение к кожухам».

В украинской ономастике фамилия Кожухар встречается чаще, чем в северных русских областях, что неудивительно: кожух как традиционная верхняя одежда был особенно распространён в Поднепровье и на Слобожанщине. В России аналогичная фамилия могла трансформироваться в Кожухов — через стандартный суффикс -ов, означающий принадлежность («сын Кожуха»). Если же встречается вариант Кожухар, это прямое указание на ремесло, а не на отчество.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -ар/-яр отмечена как продуктивная для обозначения профессий, но в фамилиях она закрепилась реже, чем -ов/-ев. Поэтому Кожухар — более редкий и архаичный вариант, сохранивший живую связь с ремеслом. Есть и альтернативная версия: в некоторых говорах «кожухар» могли называть не портного, а того, кто выделывал овчины, то есть кожевника, специализирующегося на шкурах для тулупов. Но первое значение — швея-скорняк — исторически правдоподобнее, так как кожух требовал именно портновского навыка кроя и сшивания, а не только обработки кожи.