Фамилия Кожухарь — из числа тех, что прямо указывают на ремесло предка. В основе лежит украинское слово «кожух» — тулуп из овчины. Соответственно, кожухарем в Малороссии называли портного, который такие тулупы шил. Это не единственное значение: в некоторых говорах кожухарем могли называть и скорняка, выделывающего овчину, или просто человека, торгующего кожухами. Но главное — ремесленная основа фамилии не вызывает сомнений.

Обратим внимание на суффикс. В отличие от великорусских фамилий на -ов (Кожухов), украинская модель образования через суффикс -арь (как Бондарь, Гончарь, Кобзарь) сохранила исходное название профессии почти без изменений. Фамилия Кожухарь — это застывшее прозвище, которое перешло к потомкам без дополнительных патронимических суффиксов. Именно такая модель типична для западнорусских и украинских земель, где ремесленные прозвища часто становились фамилиями в своей исходной форме.

Встречается эта фамилия в основном на Украине и в южных областях России, куда переселялись украинские крестьяне и ремесленники. В дореволюционных переписях Кожухарей записывали преимущественно среди мещан и казаков — сословий, где ремесло было основным источником дохода. Дворянских родов с такой фамилией не отмечено: слишком прямо она указывает на занятие простого мастерового человека.