Фамилия Козляткин образована от мирского имени Козлятка — так могли назвать ребёнка в дохристианской традиции. Основа имени — слово «козёл». Подобные «животные» имена (Козёл, Козлик, Козля) были частью древней славянской практики: давая младенцу такое имя, родители верили, что природа примет его за своего и передаст ему качества, приписываемые этому животному — выносливость, упрямство, плодовитость. Со временем имя Козлятка закрепилось как прозвище, а его потомки стали Козляткиными.

Словообразовательная модель проста: к основе Козлят- добавлен суффикс -к- (уменьшительный, характерный для личных имён), затем фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Козляткин, то есть сын или потомок Козлятки. Такая модель (основа на -а/-я + -ин) типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на гласный.

В отличие от более частых Козловых и Козловских, фамилия Козляткин встречается редко. Если Козловых в России десятки тысяч, то Козляткиных — единичные случаи, что говорит о локальном бытовании прозвища Козлятка. Скорее всего, фамилия закрепилась в одной или нескольких соседних деревнях, где жил человек с таким прозвищем, а его дети и внуки уже носили фамилию по отцу.

Интересно, что в основе — не «козёл» напрямую, а «козля», то есть детёныш козы. Это могло быть ласкательное прозвище для маленького, вертлявого или шаловливого ребёнка, а не указание на взрослое животное. В ономастике это нередкий случай: прозвище по детёнышу (Теляткин, Жеребяткин, Козляткин) подчёркивает не столько характер, сколько возраст или внешность первого носителя. Потомок человека по прозвищу Козлятка и получил фамилию Козляткин.