Фамилия Козубовская — одна из тех, где прозвище предка ясно указывает на его дело. В основе лежит украинское слово «козуб» — лукошко, корзина, сплетённая из лыка или прутьев. Первый носитель этого прозвища, скорее всего, занимался плетением и продажей корзин, то есть был ремесленником, чей товар знали в округе. Хотя «козуб» — слово украинское, фамилия бытует и на юге Беларуси, что говорит о давних связях этих земель.

Особенность фамилии — суффикс -овск-/-евск-. Он характерен для фамилий польской и западнорусской шляхты, но в украинской и белорусской среде его часто получали крестьяне и мещане, когда переселялись или меняли место жительства. Модель образования проста: к прозвищу отца (Козуб) добавили притяжательный суффикс -ов- (Козубов), а затем — шляхетский -ский, что буквально значит «принадлежащий Козубу» или «выходец от Козуба». Так фамилия получила книжное, «благородное» звучание, хотя исходное занятие было самым что ни на есть простонародным.

Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог — Козубо́вская, хотя в некоторых говорах встречается вариант с ударением на «у». Вариантов написания немного: в старых документах можно встретить Козубовска (без мягкого знака) или Козубовский (для мужчин). Женская форма на -ская закрепилась стандартно.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Козубовский/Козубовская стоит в одном ряду с более простыми Козуб, Козубенко, Козубенков. Все они — от одного корня, но суффикс -овск- указывает на более позднюю, «официальную» фиксацию фамилии, возможно, уже при переписях XIX века.