Фамилия Козырис — редкий случай, когда основа не лежит на поверхности, а суффикс заставляет задуматься. Скорее всего, перед нами не русская, а украинская или польская по происхождению фамилия, и ключ к её пониманию — окончание -ис.

В русской модели фамилий такой суффикс нехарактерен. Зато в украинской и польской ономастике -ис (или -ыс) может быть остатком старого патронимического суффикса, либо адаптацией греческого -идис/-ис, который встречается в фамилиях греков Приазовья и юга Украины. Если это так, то корень «Козыр» восходит к прозвищу Козырь.

Прозвище Козырь на юге и западе бывшей Российской империи было широко распространено. Оно могло означать человека бойкого, удачливого, «козырного» — того, кто умеет выйти сухим из воды, или, наоборот, задиристого. В карточных терминах «козырь» — старшая масть, так что прозвище могло быть ироничным или уважительным. В украинских говорах слово «козир» также означало щиток у ружья или козырёк фуражки, но перенос на характер человека вероятнее. Соответственно, Козырис — это «сын Козыря» или «потомок Козыря», где -ис играет роль уменьшительно-патронимического форманта, как в фамилиях типа Харкис, Павлис.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с греческой фамилией Козирис (от греч. κόζη — «кость» или личного имени). Но написание через «ы» (Козырис, а не Козирис) указывает на славянскую огласовку и тяготеет к украинской или польской среде.

Географически фамилия встречается в основном на западе Украины и в южных областях России, куда переселялись украинцы и греки. Сословной привязки у неё нет — Козырисами могли быть и казаки, и крестьяне, и мещане. Сегодня фамилия остаётся малочисленной, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска: каждый её носитель, скорее всего, связан с одной из немногочисленных ветвей рода.