Фамилия Козыря — случай, когда прозвище стало фамилией почти без изменений, сохранив свою первоначальную форму. В русской традиции фамилии на -а, -я обычно имеют украинские или белорусские корни, и Козыря — не исключение. Если бы фамилия образовалась в великорусских говорах, она чаще всего получила бы суффикс -ов (Козырев) или -ин (Козырин). Форма Козыря указывает, что предок носителя фамилии был прозван так напрямую, и это прозвище закрепилось за родом в западнорусских землях, на территории современной Украины или Белоруссии.

Основа прозвища — слово «козырь». В карточной игре козырь — старшая масть, бьющая любую другую. Переносное значение — человек бойкий, уверенный в себе, умеющий постоять за себя и выйти победителем из любой ситуации. В некоторых диалектах «козырем» называли также задиру или забияку. В словаре Даля зафиксировано выражение «ходить козырем» — держаться молодцевато, с показной удалью. Скорее всего, первый носитель прозвища Козыря выделялся либо лихостью и смелостью, либо, наоборот, кичливостью и желанием показать себя.

Встречается и другая, менее распространённая версия: связь с глаголом «козырять» в значении «отдавать честь по-военному». Но эта гипотеза слабее, так как военная терминология редко становилась основой для прозвищ в крестьянской среде, где фамилии в основном и складывались. Правдоподобнее выглядит связь с карточной игрой — она была повсеместна, и прозвища по ней давали часто.

В сословном отношении фамилия Козыря почти наверняка принадлежала крестьянам или казакам. Дворянские фамилии на -а встречаются редко, а форма без суффикса — признак позднего закрепления фамилии, характерного для непривилегированных слоёв. Географически фамилия концентрируется в южных и юго-западных регионах России, а также на Украине — это подтверждает её украинское происхождение.

Фамилия Козыря стоит в одном ряду с такими же прозвищными фамилиями, как Шуляк, Гуляка, Непийвода. Все они — короткие, ёмкие, без лишних суффиксов, и по ним можно составить портрет предка: скорее всего, это был человек с характером, не робкого десятка, умевший «бить козырем» в жизни.