Фамилия Козюкова, скорее всего, восходит к мужскому крестильному имени Косма. В русском языке оно обросло множеством обиходных форм: самая известная — Кузьма, а также Козьма и уменьшительные варианты вроде Козюк. Греческое слово kosma, от которого всё пошло, означало «мир», «порядок», «мироздание» и, в переносном смысле, «украшение». Именно прозвищная или домашняя форма Козюк и легла в основу фамилии.

При разборе фамилии бросается в глаза её суффикс — Козюк-ов-а. Модель типична для русских фамилий: к основе (Козюк) добавили притяжательный суффикс -ов, который отвечает на вопрос «чей?». В итоге Козюкова означает «дочь (или жена) Козюка». Поскольку фамилия стоит в женском роде, её исходная мужская форма — Козюков. Такая модель была особенно распространена в центральных и южных регионах России, где фамилии на -ов встречаются чаще всего.

Святым покровителем имени считается преподобный Косма Маиумский, известный как творец церковных канонов. Однако в народной среде имя чаще ассоциировали не с византийским песнопевцем, а с практичными святыми Космой и Дамианом, которых почитали как покровителей ремёсел и врачевания. Поэтому предок-носитель имени Козюк мог быть и кузнецом, и плотником, и просто крестьянином, которого в быту звали уменьшительно, чтобы отличать от других Козьм в деревне.

В отличие от более частых фамилий вроде Кузьмин или Козьмин, вариант Козюков встречается реже. Это говорит о том, что форма Козюк бытовала в определённых говорах — скорее всего, в южнорусских или украинских диалектах, где смягчение согласных и суффикс -юк были обычным делом. Таким образом, фамилия Козюкова хранит не только память о далёком предке по имени Косма, но и о местной языковой особенности, которая со временем закрепилась в официальном родовом имени.