Фамилия Краснопольев построена по редкой для русского ономастикона модели — суффикс -ев присоединён к основе, оканчивающейся на -ой. Обычно притяжательные прилагательные в фамилиях дают формы вроде Краснопольский (с суффиксом -ск-) или Краснополов (от прозвища Краснопол). Здесь же мы видим прямой перенос топонима или прозвища Краснополь (Краснополье) с добавлением родового суффикса -ев. Это указывает, что предок носителя фамилии либо происходил из селения с названием Красное Поле, либо сам получил прозвище по месту жительства — «красное поле» в древнерусском языке означало не цвет, а «красивое, парадное, плодородное» поле.

Вторая, менее очевидная версия связывает фамилию с диалектным словом «краснополый». В южных и западных говорах «полый» — полый, открытый, а «краснополый» могло означать человека, носившего красную полость (верхнюю одежду) или имевшего участок земли без леса. Однако эта гипотеза слабее: суффикс -ев в таком случае должен был бы присоединяться к основе «Краснопол», а не «Краснополь».

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине. Названия Краснополье встречаются в Харьковской, Сумской и Белгородской областях. В XIX веке носители фамилии фиксировались среди мещан и однодворцев — потомков служилых людей, селившихся на южных рубежах. Один из ранних документов: в метрической книге города Харькова за 1780 год упомянут мещанин Иван Краснопольев.

Сравните с однокоренными фамилиями: Краснопольский — более распространённая форма, указывающая на дворянское или духовное происхождение (по названию имения или прихода). Краснополов — вариант от прозвища, без топонимического оттенка. Краснопольев стоит особняком: её окончание -ев при основе на мягкий знак — признак того, что фамилия оформлялась в народной среде, а не в канцелярии.