Фамилия Кратиньков — редкий случай, когда суффикс выдаёт не географию, а конкретную социальную модель образования. На первый взгляд, кажется, что перед нами типичная русская фамилия на -ов, образованная от прозвища или имени. Но суффикс -иньк-, а затем -ов, указывает на особый путь: это не просто «сын Кратинька», а скорее «внук» или «человек из рода того, кого звали Кратинька».

Основа «Кратинь» или «Кратиня» — тёмная. В русских говорах и документах XV–XVII веков такого слова не зафиксировано. Самая вероятная версия — это производное от греческого имени Кратин, которое было известно в православных святцах. Мученик Кратин (или Кратет) почитается в лике святых, и имя это, хоть и редко, но давали при крещении. В просторечии полное имя Кратин легко превращалось в уменьшительное Кратиня или Кратинька — по той же модели, что Антип — Антипка, Фока — Фокинька. Суффикс -иньк- в русских фамилиях чаще встречается в южнорусских и западнорусских землях (сравните фамилии Ходиньков, Терпиньков), поэтому носители фамилии Кратиньков, скорее всего, происходят из районов бывшего Великого княжества Литовского или юга Московского государства.

Менее правдоподобна, но возможна связь с диалектным словом «кратинь» — так в некоторых говорах называли коротышку или человека с резкими, отрывистыми движениями (от «краткий»). Однако эта версия слабая: слово «кратинь» не зафиксировано в авторитетных словарях русских говоров, а фамилии от прилагательных обычно образуются иначе.

Таким образом, Кратиньков — это фамилия-отчество в третьем поколении. Предок носителя звался Кратинька (в быту), а его отца, вероятно, звали Кратин — по церковному имени. Фамилия редкая, недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская, и её носители жили компактно в одной местности, где имя Кратин не было забыто.