Фамилия Крейнин — это указание на имя основателя рода, и ее разбор стоит начать с самого имени Крейн. Оно рассматривается как краткая форма имени Квирин (Quirinus), которое было особенно популярно в Средние века. Имя восходит к латинскому слову quiris — «копье», а буквальное значение — «копьеносный». В античной традиции этот эпитет относился к богу Марсу, основателю Рима Ромулу, а также к императорам Антонию и Августу.

Географически имя Крейн встречается преимущественно в Западной Германии. Это дает основание предположить, что основатель рода Крейниных мог быть выходцем из западных немецких земель. Однако фамилия Крейнин — это уже русская модель, образованная с помощью суффикса -ин. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Крейнин, то есть потомок или человек из семьи Крейна. Такой способ образования типичен для фамилий, которые фиксировали имя или прозвище отца.

Фамилия Крейнин — самобытный памятник еврейской культуры, но ее корни ведут в германскую языковую среду. Это не редкость: многие еврейские фамилии ашкеназского происхождения вобрали в себя элементы местных языков — немецкого, идиша, славянских. Имя Крейн могло бытовать среди еврейского населения Германии, а затем, при переселении в Восточную Европу, обрасти русским суффиксом. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии можно лишь на основании серьезных генеалогических изысканий, но связка «западногерманское имя + русский суффикс» — наиболее вероятная модель.