Фамилия Крупенин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. В основу данной фамилии легло прозвище Крупа. По другой версии, фамилия Крупенин произошла от прозвища, которое относилось к человеку небольшого роста или совсем еще незрелому, крошке. Возможно, что данная фамилия связана со словом «круп», которым называют и наиболее широкую часть спины лошади, и детскую болезнь, характеризующуюся воспалением гортани и дыхательного горла. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Крупа, со временем получил фамилию Крупенин. О точном месте и времени возникновения фамилии Крупенин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Крупенин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.