Фамилия Крупянко — характерный пример украинской модели образования фамилий. Её основа — прозвище или мирское имя Крупяный, а суффикс -ко (встречается также в формах -енко, -ук, -юк) указывает на происхождение из восточно-украинских или южнорусских земель. В украинской ономастике суффикс -ко исторически выполнял роль уменьшительного или указывал на принадлежность: «сын Крупяного» или «потомок человека по прозвищу Крупяный». Такая модель была особенно распространена в Запорожской Сечи и среди казачества, где фамилии часто закреплялись за целыми родами по старшему предку.

Само прозвище Крупяной — многозначное. С одной стороны, оно могло относиться к роду занятий: крупяник — тот, кто торгует крупой, или работник на крупорушке. С другой — в говорах «крупяной» иногда означало «крепкий, плотный, крупного телосложения». Была и ироничная версия: так могли прозвать человека, который из-за болезни или увечья был «рассыпчатым», то есть слабым, немощным — противоположность «крупному». В народной этимологии нередко сталкиваются эти два смысла, но профессиональное толкование выглядит убедительнее: фамилии от названий продуктов и ремёсел встречаются повсеместно (Гречко, Пшеничный, Солодуха), а прозвища по физическому недостатку обычно имеют более жёсткие корни (Кривой, Безрукий).

Интересно, что фамилия Крупянко почти не встречается в центральных и северных русских регионах — её ареал чётко привязан к левобережной Украине и прилегающим областям России (Курская, Белгородская, Воронежская). В документах XVII–XVIII веков носители фамилии фиксируются среди реестровых казаков и мещан Полтавщины и Черниговщины. Таким образом, предки современных Крупянко с высокой вероятностью были либо ремесленниками, связанными с переработкой зерна, либо казаками, получившими прозвище за стать и силу. Точных упоминаний в известных ономастических словарях (Унбегаун, Никонов) по этой фамилии нет, что делает её хорошим примером народной, недворянской фамилии, сложившейся в среде сельских жителей и казачества.