Фамилия Крылков образована от прозвища Крылко — уменьшительной формы от слова «крыло». В древнерусском языке «крылко» могло означать не только маленькое крыло, но и часть механизма, рычаг, а также нечто похожее на крыло по форме или функции. Чаще всего такое прозвище давали человеку с какой-то заметной особенностью — например, с длинными руками, быстрому бегуну, или тому, кто носил широкую, развевающуюся одежду.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов присоединился к основе Крылк-, образовав притяжательное прилагательное в значении «сын Крылка». Это типичная русская фамилия на -ов, характерная для северных и центральных областей России. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывались от основ на -а/-я, здесь форма на -ов указывает на мужское прозвище с окончанием на согласный.

В ономастических словарях фамилия Крылков обычно связывается с неканоническим именем или прозвищем Крылко. Встречается и версия о происхождении от названия птицы, но она менее убедительна: прозвища от частей тела или предметов быта в русской антропонимии встречаются чаще, чем зооморфные уменьшительные формы. Прямых упоминаний в труде Б. Унбегауна «Русские фамилии» нет, но модель полностью укладывается в описанные им типы.

Географически фамилия Крылков встречается в основном в Поволжье и на Урале, что подтверждается данными современных телефонных справочников и списков участников Великой Отечественной войны. В дореволюционных источниках Крылковы фиксируются среди крестьян и мещан — никаких указаний на дворянское происхождение нет. Возможно, предки носителя фамилии были мастерами-ремесленниками, работавшими с крыльями мельниц или ткацких станков, но это лишь предположение, не подтверждённое документально.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Крылов, Крылатов, Крыльцов — показывает, что Крылков стоит особняком: суффикс -к- в основе делает прозвище более конкретным, почти бытовым, в то время как Крылов отсылает напрямую к птице, а Крылатов — к эпитету. Это редкий случай, когда уменьшительная форма не стала именем, а сразу закрепилась как прозвище.