Фамилия Ксёндз — один из тех случаев, когда прозвище прямо указывало на род занятий предка. В основе лежит слово «ксендз» — так в Польше и в западных регионах, входивших в состав Речи Посполитой, называли католического священника. Фамилия закрепилась за человеком, который либо сам был духовным лицом, либо, что встречалось чаще, служил у ксендза (например, работником в костёле или прислугой). Иногда прозвище давали и тому, кто вёл себя важно, держался с достоинством, напоминая окружающим священника.

Важная особенность этой фамилии — её бессуффиксное образование. В русской ономастике фамилии обычно получали суффиксы -ов, -ин, -ский, но Ксёндз осталась в чистом виде, без наращений. Такая модель типична для украинских, белорусских и польских фамилий, где прозвище переходило в фамилию без изменений. Это указывает на западнорусское или польское происхождение рода.

Написание фамилии тоже не случайно: мягкий знак после «д» (Ксёндз, а не Ксендз) отражает польскую фонетику — мягкое произношение końcowego звука. Встречаются варианты Ксенз, Ксендзов, но исходная форма сохраняет связь с первоисточником.

По социальному составу носители фамилии Ксёндз относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Священники в католической традиции не передавали фамилию по наследству в том же смысле, что крестьяне, поэтому потомки ксендза скорее всего были мирянами, получившими прозвище от окружающих.

В ономастических словарях фамилия Ксёндз нередко соседствует с однокоренными Ксендзов, Ксендзук, Ксендзык — все они восходят к той же основе, но различаются суффиксами, характерными для разных регионов. Сама же форма Ксёндз без суффикса — самая прямая и архаичная, она сохранилась в основном в Беларуси и на западе Украины.