Фамилия Кубаханов — редкий пример, где географический и этнический след просматривается почти однозначно, хотя точная основа может вызвать споры. Сразу скажем главное: носители этой фамилии — почти поголовно выходцы из Дагестана, чаще всего среди кумыков, лезгин или аварцев. Суффикс -ов указывает на русификацию фамилии в XIX–XX веках, когда горцам при переписях добавляли русское окончание. Но ядро фамилии — корень Кубахан.

Здесь две рабочие версии. Первая: Кубахан — это тюркское (кумыкское) имя или прозвище, где «Куба» может означать «светлый», «бледный» или «сивый» (о масти коня), а «хан» — традиционный титул. В таком случае имя Кубахан давали человеку со светлыми волосами или кожей, что на Кавказе всегда бросалось в глаза. Вторая версия: фамилия связана с топонимом Куба — река или местность (сравните с Кубанью). Тогда Кубаханов — «тот, кто с Кубы», с добавлением уменьшительного или патронимического -хан.

Спор между этими версиями решается просто: фамилия Кубаханов почти не встречается за пределами Дагестана и Чечни, а в тюркских языках Кавказа компонент «хан» в личных именах — обычное дело (сравните: Алихан, Магомедхан). Поэтому скорее всего перед нами патроним от мужского имени Кубахан, которое со временем закрепилось как фамилия. В русских документах XIX века такие имена часто записывали на слух, поэтому возможны варианты написания: Кубаханов, Кубахан, Кубаханов. Встречается также форма Кубаханов с ударением на второй слог.

Сословно фамилия не маркирована: среди Кубахановых были и уздени (свободные крестьяне), и представители сельской знати. Никаких громких исторических личностей под этой фамилией в общероссийских источниках не зафиксировано — это фамилия не «княжеская» и не «церковная», а бытовая, образованная от личного имени. Если ваш предок носил её, он был, скорее всего, горцем, жившим в ауле, и его семья вела свою родословную от человека по имени Кубахан.