Фамилия Кубаров — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её корни, стоит в первую очередь разобрать суффиксальную модель. Формант -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Кубаров, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Кубар (или Кубарь). Основа фамилии — это мужское прозвище или неканоническое имя.

Самая прямая и правдоподобная версия связывает прозвище Кубарь с диалектным словом «кубарь». В русских говорах так называли детскую игрушку — волчок, юлу. Прозвище могли дать человеку непоседливому, вертлявому, суетливому, который «вертится как кубарь». Такие прозвища по поведению были типичны для русской деревни. Менее вероятно, но возможно, что прозвище образовано от глагола «кубарить» — опрокидывать, кувыркать, что также описывало бы манеру поведения.

Вторая версия, хоть и менее распространённая, отсылает к тюркским языкам. В них есть корень «куб» (или «коб») со значением «много», «обильный», а также «кубар» как обозначение цвета (бурый, серый). Однако фамилия Кубаров не имеет типичных тюркских суффиксов (-ов здесь уже русский), и основное бытование её фиксируется в центральных и северных областях России, что делает тюркскую версию менее вероятной для большинства носителей.

Интересно, что фамилия Кубаров стоит в одном ряду с однокоренными, но более редкими фамилиями — Кубарь, Кубарёв, Кубарин. Форма Кубаров — самая «стандартная» с точки зрения русского словообразования, что говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином или посадским человеком, а не представителем духовенства или дворянства (у тех чаще встречались фамилии на -ский). Встретить Кубаровых можно в разных регионах, но чаще всего — в Поволжье и на Урале, куда в XVII–XVIII веках активно переселялись крестьяне из центральной России, принося с собой прозвища.