Фамилия Кубит — редкий пример польского по происхождению родового имени, которое в основе своей имеет библейское имя Иаков. В польской традиции имя Иаков преобразовалось в уменьшительно-ласкательную форму Куба, а от неё, в свою очередь, могли образовать и прозвище, и фамилию — Кубит. Исходное древнееврейское имя означает «второй по рождению», то есть идущий следом, держащийся за пятку.

Словообразовательная модель фамилии указывает на польский суффикс -ит, который встречается в фамилиях, образованных от имён или прозвищ. Это не типичный для русских фамилий суффикс, что сразу выдаёт западнославянское происхождение рода. Если бы фамилия была русской, мы бы скорее увидели форму Кубин или Кубиков.

Судя по сохранившимся записям, носители фамилии Кубит жили на западных рубежах Российской империи. В Книге памяти Смоленской области упоминается Александр Семенович Кубит, родившийся в 1903 году в Волынской области — это историческая область на северо-западе современной Украины, где веками жили поляки и украинцы. Другая запись, из Книги памяти Республики Саха (Якутия), сообщает о Франце Николаевиче Кубит, родившемся в 1896 году в польском городе Кросно. Оба случая подтверждают: фамилия бытовала среди католического польского населения, которое впоследствии оказалось втянуто в процессы переселения и репрессий советского времени.

Географически фамилия Кубит не получила широкого распространения в центральной России. Её ядро — западные губернии (Волынская, Гродненская) и собственно Польша. После Второй мировой войны часть носителей могла оказаться в Сибири и на Дальнем Востоке в результате депортаций или ссылок, чем и объясняется присутствие фамилии в якутских списках.

Если отбросить версию с библейским именем, существует и более прозаическое объяснение: в польском языке слово «kubit» могло означать нечто маленькое, кубическое, или же быть прозвищем человека с коренастой фигурой. Однако связь с именем Иаков выглядит убедительнее — слишком много польских фамилий образовано именно от Кубы (Кубик, Кубала, Кубицкий), чтобы считать это случайностью.