Фамилия Кубий — редкий случай, когда носитель фамилии может почти наверняка указать на карту, откуда родом его предки. Это не типичная «великорусская» фамилия на -ов или -ин. Её ареал — запад Украины, в первую очередь Львовская, Ивано-Франковская и Тернопольская области. Встречается она и у поляков, что неудивительно: земли эти веками были частью Речи Посполитой.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ий (в украинском варианте -ій) указывает на притяжательное значение, то есть «чей?» — Кубий. В основе лежит имя или прозвище Куба. Это, в свою очередь, одна из народных форм христианского имени Якуб (польское Jakub, украинское Яків). В польском и украинском языках имя Якуб сокращали до Кубa, Кубець, Кубась. Так что Кубий — буквально «сын Кубы» или «человек Кубы».

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с диалектным словом «куба» — так в некоторых говорах называли короткую верхнюю одежду или мешок. Но в этом случае фамилия скорее получила бы суффикс -енко или -ук, а не -ий. Поэтому прозвищное происхождение от имени выглядит убедительнее.

Крестьяне и мещане Галичины не имели наследственных фамилий до австрийских реформ конца XVIII века. Именно тогда, при введении метрических книг и воинского учёта, за многими семьями закрепили фамилии по имени отца или деда. Так Кубий и стал официальным родовым именем. В польских записях фамилия могла писаться как Kubij, что при русификации или переходе на кириллицу дало современное написание.

Таким образом, Кубий — это фамилия-патроним, родившаяся на западноукраинских землях и указывающая на предка по имени Куба (Якуб). Носителей этой фамилии в России крайне мало, и почти все они — потомки переселенцев из Западной Украины.